西陣病院経営管理室の佐藤と申します。

検索名称をどのように登録しているか、に対する回答とは逸れますが、
「病名が見つけられない」に対する策は次の通りです（何か参考になれば…）。

当方では、MEDISの病名マスタをもとに、
｛K819，ﾏﾝｾｲﾀﾝﾉｳｼｮｳ，胆嚢炎，慢性胆のう症，慢性胆嚢症｝
の何れのキーワードを入力しても標準病名「胆のう炎」がヒットするような検索システムを構築し、
院内Webサーバーで全職員へ公開しております。
思いついたワードで探し、極力標準病名で登録するよう、医師に協力を求めております。

ただ、やはり手間がかかるということで、医師自身による病名登録は多くはありません。
「カルテ記事内に病名を記載するならこう書け」というルールがあり、
それを医事課員が拾って代行で登録している、というのが実情です。